Is-serje sseħħ erba 'snin wara l-avvenimenti ta' Magical Girl Lyrical Nanoha StrikerS, li matulhom tifla maġika Nanoha Takamachi salvat u adottat tifla żgħira bl-isem ta 'Vivio, li hija l-Reinkarnazzjoni tas-Sankt Kaiser, Olivie Segbrecht. Wara li ddaħħal ir-raba 'sena tal-iskola elementari, Vivio jingħata l-apparat ta' intelliġenza tagħha stess, Sacred Heart, u jikseb il-poter li jittrasforma billi juża l-modalità Sankt Kaiser adulta tagħha. Hekk tiltaqa 'ma' tfajla bl-isem ta 'Einhart Stratos li, simili għal Vivio, hija d-dixxendent ta' ħakkiem ieħor ta 'Sankt Kaiser, Claus GS Ingvalt. Hekk kif Einhart issir determinata li tipprova l-istil tal-ġlied tagħha huwa l-aktar b’saħħtu, Vivio jħobbha u, flimkien mal-ħbieb tagħha, jidħol f’tournament tal-arti marzjali fejn jiġġieldu kontra diversi avversarji maġiċi u jitgħallmu aktar dwar il-ħajja tal-passat tagħhom.
